Заказник «Красноярский» образован в 2010 г. с целью сохранения биологического и ландшафтного разнообразия Красноярского края, а также лесов вокруг города Красноярска. Расположен на шести территориально разобщённых кластерах общей площадью 247 265 га.
Постановлением Правительства Красноярского края от 29.07.2025 № 609-п утверждено новое наименование — государственный природный заказника краевого значения «Красноярский», внесены изменения в положение о заказнике, уточнены его границы.
