Заказник «Агапа» создан в 2013 г. на территории Таймырского Долгано-Ненецкого муниципального района Красноярского края. Включает в себя акваторию р. Агапа на 180-километровом участке нижнего течения реки от устья р. Огортыяха (места впадения в р. Агапа) до устья р. Агапа (места впадения в р. Пясина) с прилегающей территорией шириной 5 км (по 2,5 км в обе стороны от русла).
Заказник создан с целью сохранения единого ландшафтного комплекса как среды обитания объектов животного мира, сохранения и восстановления популяций редких и исчезающих видов животных, занесенных в Красные книги Российской Федерации и Красноярского края, и мониторинга их состояния, а также сохранения палеонтологических объектов.
Территория заказника является частью водно-болотного угодья Междуречье и долины рек Пура и Мокоритто, включенного в Список находящихся на территории Российской Федерации водно-болотных угодий, имеющих международное значение главным образом в качестве местообитаний водоплавающих птиц.
Постановлением Правительства Красноярского края от 07.11.2024 № 862-п установлено новое наименование ООПТ — государственный природный заказник краевого значения «Агапа». Утверждены новая редакция положения о заказнике и графическое описание местоположения его границ.
Режимом особой охраны территории заказника запрещена охота в период с 20 мая до 15 августа, за исключением охоты, в целях обеспечения ведения традиционного образа жизни и осуществления традиционной хозяйственной деятельности.